Au Quartier Général, situé dans la tête de Riley, 11 ans, cinq Émotions gèrent son quotidien : Joie, optimiste et bienveillante, veille à son bonheur ; Peur s'occupe de sa sécurité ; Colère défend la justice ; Dégoût la protège des mauvaises expériences, et Tristesse cherche encore sa place.
Lorsque Riley déménage dans une grande ville, les Émotions doivent l'aider à traverser cette transition difficile. Mais Joie et Tristesse se retrouvent accidentellement perdues dans les profondeurs de l'esprit, emportant des souvenirs essentiels.
Pendant ce temps, Peur, Colère et Dégoût tentent de gérer seules. Joie et Tristesse explorent des lieux insolites comme la Mémoire à long terme et le Pays de l’Imagination pour retrouver le Quartier Général et aider Riley à avancer.
